اتجه أمير المؤمنين إلى المحراب في مسجد الكوفة وبدا يصلي وكان عليه السلام يطيل الركوع والسجود في صلاته فقام ابن ملجم واقبل مسرعا يمشي حتى وقف بإزاء الاسطوانة التي كان الإمام يصلي عندها فأمهله حتى صلى الركعة الأولى وسجد السجدة الأولى ورفع رأسه منها وشد عليه اللعين ابن ملجم فضرب الإمام على رأسه فشقه نصفين فوقع يخور بدمه وهو يقول :
بسم الله وبالله وعلى ملة رسول الله

ثم صاح الإمام :
فزت ورب الكعبة .
فاصطفقت أبواب الجامع , وضجت الملائكة في السماء وهبت ريح سوداء مظلمة ونادى جبرائيل بين السماء والأرض :
تهدمت والله أركان الهدى وانطمست والله نجوم السماء وأعلام التقى وانفصمت والله العروة الوثقى , قتل ابن عم المصطفى , قتل الوصي المجتبى , قتل علي المرتضى قتل سيد الأوصياء ,

قتله أشقى الأشقياء