تتواجد الأحجار الكريمة في أغلب الأحيان في المناطق ذات الطابع البركاني ، حيث إنّ بعض أنواع الأحجار الكريمة تتكوّن في باطن الأرض وعلى أعماق مختلفة، ويمكن تكوّن الأحجار الكريمة في طبقات الأرض القريبة من السطح، وهذا يعني أنّه من الممكن أن تتواجد على عمق ١٦٠ متر، وتخرج إلى سطح الأرض عند حدوث البراكين والهزّات الأرضية، مثل: الياقوت، والألماس، والزمرد. هذه الأحجار النفيسة تتواجد في الطبيعة لوحدها حرة، كما تتواجد الأحجار الكريمة في أعماق البحار والمحيطات ، وبعضها يوجد فوق سطح الأرض نتاجا للتفاعلات الاحيائية في المملكة النباتيّة مثل الكهرمان الأصفر.